嘉義車庫園區日治時期舊名「北門修理工場」，原址設於1910年10月平地段通車時的北門機關庫，隨著鐵路的施工陸續擴充，才於大正元年(西元1912年)正式啟用，主要工作為建造修理阿里山鐵路各式機車、客車、貨車，迄今已將近百年的歷史。

從阿里山通車以來，修理工廠一直是維修的大本營，雖說當年火車購自美國，但北門修理工廠當年編置一兩百人，維修、改裝、製造樣樣功力高強，零件損壞自己手工打造，外鍋爐、蒸汽引擎也能自產，阿里山檜木車廂也是修理廠的經典傑作之一，許多珍貴阿里山退休火車，目前也是保存在北門修理工廠。

民國82年8月23日，北門修理工廠發生一場大火燒掉木造廠房，部份老火車也付諸一炬。現今部份修理工廠建築已經更新，少數較珍貴的車輛，則停放在車庫裡保存。為了讓民眾可以參觀這個饒富歷史意義的所在地，民國94年起改名為嘉義車庫園區。